Mentre non era uno scienziato addestrato, era un drastro olandese e un macinacapo che aveva un talento notevole per la creazione di microscopi. Ha usato i suoi microscopi per esaminare un'ampia varietà di esemplari, tra cui acqua dello stagno, acqua piovana e la sua saliva. Fu in questi campioni che osservava piccole creature in movimento, che chiamava "animali".
Queste "animali" erano in realtà batteri e le osservazioni di Leeuwenhoek erano rivoluzionarie, poiché rivelavano un mondo completamente nuovo di vita microscopica che era precedentemente sconosciuta.