* Nucleo: Questo è l'organello più importante e noto contenente DNA. Ospita la maggior parte del materiale genetico della cellula sotto forma di cromosomi.

* Mitocondri: Questi organelli, spesso indicati come "centrali elettriche della cellula", hanno la loro molecola circolare di DNA separata dal DNA nucleare. Questo DNA mitocondriale (mtDNA) codifica per alcune delle proteine coinvolte nella respirazione cellulare.

* Cloroplasti: Trovati solo nelle cellule vegetali, questi organelli sono responsabili della fotosintesi. Contengono anche la loro molecola circolare di DNA, nota come DNA di cloroplasto (cpDNA), che codifica per le proteine coinvolte nella fotosintesi e in altre funzioni di cloroplasti.

Mentre questi sono gli organelli primari con il proprio DNA, vale la pena notare che alcuni altri organelli possono avere tracce di DNA, ma non è considerata una caratteristica distintiva di questi organelli.