Ecco una rottura di ciò che rende un fillotipo:
* Basato su sequenze di DNA: I filotipi sono definiti dalle sequenze uniche di un gene o una regione genetica specifica, di solito con una soglia specifica per quanto simili le sequenze debbano essere considerate lo stesso filotipo.
* Non necessariamente una specie: Un filotipo potrebbe corrispondere a una specie nota, ma può anche rappresentare un gruppo di organismi strettamente correlati che non sono stati formalmente classificati come specie.
* utile per lo studio delle comunità microbiche: I filotipi sono particolarmente importanti nello studio delle comunità microbiche, in cui i metodi tassonomici tradizionali sono spesso difficili o impossibili da applicare a causa della vasta diversità dei microrganismi.
Ecco alcuni punti chiave sui filotipi:
* Sono unità tassonomiche operative (OTUS): I filotipi sono spesso usati in modo intercambiabile con il termine "unità tassonomica operativa" (OTU), che si riferisce a qualsiasi gruppo di organismi considerati un'unità distinta per l'analisi.
* Possono essere definiti a diversi livelli tassonomici: Un filotipo potrebbe rappresentare una specie, un genere o un gruppo tassonomico più specifico, a seconda del gene scelto e della soglia di somiglianza della sequenza.
* Sono dinamici: Le definizioni di filotipo possono essere riviste man mano che diventano disponibili più dati di sequenza e la nostra comprensione della diversità microbica si evolve.
In sintesi: I filotipi sono uno strumento potente per comprendere la diversità e l'evoluzione microbica. Consentono ai ricercatori di raggruppare organismi basati sulle loro relazioni genetiche, anche quando i metodi tassonomici tradizionali non sono fattibili. Ciò è particolarmente importante nello studio delle comunità microbiche, in cui identificare e classificare le singole specie può essere una sfida.
