* pirofosfato (PPI): Questa è una molecola costituita da due gruppi di fosfato collegati insieme. Viene rilasciato durante la formazione del legame fosfodiestro tra il gruppo fosfato di un nucleotide e lo zucchero di un altro.
* Acqua (H₂O): Questo viene rilasciato durante la reazione di condensa che collega la base nucleotidica alla molecola di zucchero.
Ecco una rottura del processo:
1. Attivazione: Viene attivato un trifosfato nucleosidico (NTP) come ATP, GTP, CTP o TTP. Ciò comporta la rottura di un legame ad alta energia all'interno dell'NTP, rilasciando il pirofosfato (PPI).
2. Allegato: Il nucleotide attivato, ora un monofosfato nucleosidico (NMP), è attaccato al gruppo idrossile 3 'di una catena di polinucleotidi in crescita. Ciò comporta una reazione di condensa che rilascia acqua (H₂O).
In sintesi:
* Sintesi nucleotidica implica la formazione di un legame fosfodiestro e una reazione di condensa, rilasciando pirofosfato (PPI) e acqua (h₂o) , rispettivamente.
Nota importante: Il pirofosfato (PPI) viene ulteriormente suddiviso in due molecole di fosfato inorganico (PI) da un enzima chiamato pirofosfatasi. Questa reazione è altamente favorevole e spinge in avanti la reazione di sintesi nucleotidica.