* Entrambi sono costituiti da atomi. I mattoni di base di tutta la materia, che si tratti di una semplice molecola d'acqua o di una proteina complessa, sono atomi.
* Seguono entrambi le leggi della chimica. I principi del legame chimico, della cinetica di reazione e della termodinamica si applicano ugualmente alle molecole organiche e inorganiche.
* Entrambi possono partecipare alle reazioni chimiche. Entrambi i tipi di molecole possono interagire tra loro e formare nuove sostanze attraverso reazioni chimiche.
* Entrambi possono essere trovati negli organismi viventi. Sebbene le molecole organiche siano i principali blocchi di vita della vita, le molecole inorganiche svolgono ruoli cruciali nei processi biologici. Ad esempio, l'acqua è essenziale per tutti gli esseri viventi e minerali come calcio e ferro sono necessari per varie funzioni corporee.
In sostanza, le molecole organiche e inorganiche fanno entrambe parte dello stesso mondo chimico e sono governate dalle stesse leggi fondamentali della chimica. Differiscono semplicemente nei tipi di atomi che contengono e nella complessità delle loro strutture.