Gli squali potrebbero non essere gli animali più a rischio in via di estinzione, ma dal 2011 sono in difficoltà. L'Unione internazionale per la conservazione della natura elenca 143 specie di squali come "in pericolo" o "in pericolo di estinzione" "quasi minacciate" o "vulnerabili" nella sua "Lista rossa" e altre 210 sono elencate come "carenti di dati". Meno di un quarto delle specie di squali conosciute nel 2011 erano classificate come "minor preoccupazione", come in nessuna minaccia immediata.
Oceano aperto
Gli squali pelagici o oceanici popolano le acque profonde dell'oceano aperto . Gli squali pelagici minacciati includono il famoso squalo bianco, malamente travisato. Sono anche preoccupanti le più grandi specie di squali, gli squali elefante e le balene. Lo squalo blu ampiamente distribuito è numeroso a partire dal 2011, ma è classificato come quasi minacciato perché circa 20 milioni di individui sono catturati da uomini ogni anno. Secondo il World Wide Fund for Nature, l'industria delle pinne di squalo rappresenta circa la metà di quel numero.
Continental Shelf
La piattaforma continentale, il confine tra le masse terrestri e i bacini oceanici, è la casa di una grande varietà di squali. Molti di loro sono noti per essere in pericolo, tra cui sei specie di squali martello dall'aspetto bizzarro e 13 specie di squalo angelo. Altri sono elencati come carenti di dati.
Costiere
Squali che le frequenti regioni costiere sono vulnerabili alle attività umane. A causa del rischio reale o percepito per i nuotatori, questi squali sono talvolta soggetti a tentativi deliberati di sterminio. Sono anche facilmente accessibili ai pescatori di selvaggina. Specie costiere minacciate includono lo squalo tigre potenzialmente pericoloso, un bersaglio di pesca commerciale, pescatori di selvaggina e programmi di controllo degli squali. La lista minacciata e vulnerabile anche di squali innocui (per gli umani) come lo squalo tigre di sabbia.
Seafloor
Gli squali bentonici, quelli la cui casa è principalmente il fondo marino, comprendono la maggior parte degli squali più piccoli come gattuccio e pappagallini. Poco si sa della maggior parte di questi squali. Ad esempio, l'IUCN elenca la maggior parte delle specie di pappagallino come "carenti di dati", con alcuni noti per essere minacciati.