Il nome dell'isola deriva dal pino delle Bahamas (Pinus caribaea var. bahamensis), che un tempo era una specie comune sull'isola. Tuttavia, la popolazione di pini sull'isola è stata devastata da diversi uragani, tra cui l'uragano Donna nel 1960 e l'uragano Andrew nel 1992. Di conseguenza, l'isola ora ospita principalmente ceppi di pino e i pochi pini rimasti sono spesso rachitici o malato.

Nonostante la perdita degli alberi omonimi, l'isola conserva ancora il suo nome, Big Pine Key. Ciò è probabilmente dovuto al fatto che l’isola è ancora conosciuta per la sua storia di disboscamento dei pini e per la sua associazione con l’industria del pino, anche se i pini non sono più una presenza importante sull’isola.