Riassunto:
La Salmonella enterica sierotipo Typhimurium (S. Typhimurium) è un importante patogeno di origine alimentare che può causare grave gastroenterite nell'uomo. Il maiale è un importante serbatoio naturale e una fonte essenziale di infezioni da salmonellosi umana in tutto il mondo. Comprendere le basi genetiche dell’adattamento e della colonizzazione di S. Typhimurium all’interno del maiale è fondamentale per sviluppare interventi efficaci per controllare la salmonella nei sistemi di produzione di carne suina e ridurre le infezioni umane. In questo studio, abbiamo eseguito il sequenziamento dell'intero genoma di 200 isolati di S. Typhimurium ottenuti da diverse fonti lungo la catena di produzione di carne suina, compresi allevamenti di suini, macelli e prodotti a base di carne di maiale. L’analisi genomica comparativa ha rivelato la presenza di distinte varianti genomiche associate a ciascuna fase della catena di produzione, evidenziando la capacità dei batteri di adattarsi alle diverse condizioni ambientali. Gli isolati che ospitano geni di virulenza specifici, come quelli coinvolti nell'invasione intestinale e nella diffusione sistemica, sono risultati più diffusi nei suini che in altre fonti, indicando il vantaggio selettivo di questi geni per la sopravvivenza e la persistenza all'interno dell'ospite. Inoltre, abbiamo identificato isole genomiche uniche per gli isolati di S. Typhimurium provenienti da suini che potrebbero contribuire al loro adattamento e colonizzazione in questa specie ospite. Questi risultati forniscono nuove informazioni sui meccanismi genetici dell’adattamento e della persistenza dell’ospite della salmonella e identificano potenziali bersagli per il controllo della salmonella nella produzione di carne suina e la riduzione del rischio di infezione umana.
