I plasmidi autotrasmissibili possiedono i geni necessari per mediare il loro trasferimento da una cellula batterica all'altra senza richiedere alcun elemento genetico mobile aggiuntivo. Di solito, tali plasmidi codificano un sistema di secrezione di tipo IV completo (T4SS), i componenti richiesti per sintetizzare un pilus e le proteine ​​necessarie per elaborare e trasferire il DNA plasmidico dal donatore alla cellula ricevente. Il plasmide F di Escherichia coli è un tipico esempio di plasmide autotrasmissibile e contiene un gruppo di geni necessari per la sua stessa trasmissione, noti come geni tra (geni di trasferimento). Questi geni codificano per proteine ​​coinvolte nella formazione dei peli coniugativi, nel riconoscimento delle cellule riceventi, nel trasferimento del DNA plasmidico e nella regolazione del processo di accoppiamento.