Nell'elettroforesi, un campione contenente una miscela di molecole viene posto in un gel o membrana e attraverso di esso viene fatta passare una corrente elettrica. Le molecole nel campione migreranno attraverso il gel o la membrana a velocità diverse a seconda della loro carica e dimensione. Le molecole caricate positivamente (cationi) migreranno verso l'elettrodo negativo (catodo), mentre le molecole caricate negativamente (anioni) migreranno verso l'elettrodo positivo (anodo). Le molecole più piccole migreranno più velocemente delle molecole più grandi.
Man mano che le molecole migrano attraverso il gel o la membrana, formeranno bande distinte. Ciascuna banda rappresenta una molecola specifica o un gruppo di molecole che hanno proprietà simili. La posizione di una banda sul gel o sulla membrana corrisponde alla carica e alle dimensioni della molecola.
L'aspetto e il numero di bande in una separazione elettroforetica possono fornire preziose informazioni sulla composizione e sulle proprietà del campione. L'elettroforesi è ampiamente utilizzata in vari campi, tra cui la biochimica, la biologia molecolare, la genetica e le scienze forensi, per la separazione, l'identificazione e la caratterizzazione delle molecole.
Ad esempio, nell'elettroforesi delle proteine, le bande rappresentano diverse proteine che sono state separate in base alla loro carica e dimensione. Analizzando i modelli di bande, gli scienziati possono identificare e studiare proteine specifiche in un campione, rilevare anomalie o modifiche delle proteine e determinare le concentrazioni proteiche. Allo stesso modo, nell'elettroforesi del DNA, le bande rappresentano diversi frammenti di DNA che sono stati separati in base alla loro dimensione. Questa tecnica è comunemente utilizzata nell'impronta digitale del DNA, nei test genetici e nell'analisi di paternità.