Mentre i principi di base dell'estrazione del DNA rimangono gli stessi sia per gli animali che per le piante, esistono diverse differenze chiave a causa delle loro distinte strutture cellulari e composizioni chimiche.
1. Parete cellulare:
* Piante: Possedere una parete cellulare rigida fatta di cellulosa, emicellulosa e pectina, che protegge la cellula e ne mantiene la struttura. Questo muro deve essere scomposto per l'estrazione del DNA.
* Animali: Manca una parete cellulare, semplificando il processo di accesso al contenuto della cella.
2. Metaboliti secondari:
* Piante: Sintetizzare un'ampia varietà di metaboliti secondari, inclusi pigmenti, tannini e polisaccaridi, che possono interferire con l'estrazione e la purificazione del DNA. Questi composti spesso si legano al DNA, ostacolando il suo isolamento.
* Animali: Generalmente contengono meno metaboliti secondari che ostacolano l'estrazione del DNA.
3. Complessità genomica:
* Piante: Spesso hanno genomi più grandi e complessi degli animali, che richiedono fasi di purificazione più rigorose per isolare il DNA puro.
* Animali: In genere hanno genomi più piccoli e meno complessi, rendendo relativamente più semplice l'estrazione del DNA.
4. Metodi di estrazione:
* Piante: Comunemente impiegare metodi che coinvolgono:
* Interruzione meccanica: Macinatura o omogeneizzazione per rompere la parete cellulare.
* Digestione enzimatica: Usando la cellulasi e la pectinasi per abbattere la parete cellulare.
* Lisi chimica: Usando detergenti e altri prodotti chimici per interrompere la membrana cellulare.
* Animali: Spesso utilizzano metodi più semplici come:
* tampone di lisi: Contenente detergenti e sali per interrompere la membrana cellulare.
* proteinasi K: Un enzima che degrada le proteine, aiutando nell'isolamento del DNA.
5. Resa e qualità del DNA:
* Piante: La resa e la qualità del DNA possono variare in modo significativo a seconda delle specie vegetali e del metodo di estrazione.
* Animali: Generalmente produce più DNA con una purezza più elevata rispetto alle piante.
Ecco una tabella che riassume le differenze chiave:
| Caratteristica | Animale | Pianta |
| -------------------- | ----------------------------------- | --------------------------------------------------
| Parete cellulare | Assente | Presente (cellulosa, emicellulosa, pectina) |
| Metaboliti secondari | Meno | Abbondante (pigmenti, tannini, polisaccaridi) |
| Complessità genomica | Più piccolo e meno complesso | Più grande e più complesso |
| Metodi di estrazione | Più semplice | Più complesso e multiplo |
| Resa e qualità del DNA | Generalmente più alto | Variabile, spesso più basso e meno puro |
in conclusione, Mentre l'estrazione del DNA sia animale che vegetale mira a isolare il DNA puro, impiegano metodi diversi a causa di differenze intrinseche nella loro struttura cellulare e composizione.
