Tuttavia, gli organismi tradizionalmente raggruppati all'interno del Monera del Regno sono ora classificati in due domini separati:
1. Batteri: Questi sono procarioti single a cellule (privi di un nucleo) con diverse capacità metaboliche. Si trovano in quasi tutti gli ambienti sulla terra.
2. Archaea: Anche procarioti a celle singole, gli archea si trovano spesso in ambienti estremi come sorgenti termali o ambienti altamente salini. Hanno una biochimica unica e si ritiene che siano più strettamente correlati agli eucarioti (organismi con un nucleo) rispetto ai batteri.
Pertanto, sebbene il termine "monera" non sia più utilizzato, i due tipi di organismi tradizionalmente inclusi al suo interno sono batteri e archaea .
