* Record fossile: I fossili forniscono prove dirette delle forme di vita passata e della loro storia evolutiva. Possono rivelare l'ordine cronologico dell'aspetto di diversi phyla e aiutare a tracciare il loro lignaggio.
* Anatomia comparata: Il confronto tra le strutture anatomiche di diverse phyla può rivelare somiglianze e differenze che suggeriscono antenati comuni o evoluzione convergente. Ad esempio, la presenza di un notochord in Chordates suggerisce un antenato condiviso con altri phyla che possiedono questa struttura.
* Biologia molecolare: Il confronto tra sequenze di DNA, RNA e proteine può fornire prove potenti per le relazioni evolutive. Analizzando le differenze e le somiglianze in queste molecole, gli scienziati possono ricostruire alberi filogenetici che mostrano la storia evolutiva di diversi phyla.
* Biologia dello sviluppo: Confrontare lo sviluppo embrionale di diversi phyla animali può rivelare somiglianze nei percorsi dello sviluppo, suggerendo antenati condivisi. Ad esempio, la presenza di uno stadio di blastula in molti phyla animali indica un'origine evolutiva comune.
* Biogeografia: La distribuzione geografica del phyla animale può fornire indizi sulla loro storia evolutiva. Ad esempio, la distribuzione dei marsupiali in Australia suggerisce che si sono evoluti in isolamento da altri mammiferi.
È importante notare che queste diverse linee di evidenza sono spesso utilizzate in combinazione per fornire una comprensione globale delle relazioni evolutive tra phyla animale. Il campo della biologia evolutiva è in costante evoluzione man mano che emergono nuove prove e migliorano le tecniche analitiche.