Ha condotto una serie di famosi esperimenti nel 1860, usando boccette da scollo a cigno. Questi esperimenti hanno dimostrato in modo conclusivo che:
* I microrganismi non generano spontaneamente dalla materia non vivente.
* La vita può derivare solo dalla vita preesistente.
Il lavoro di Pasteur ha confutato la teoria prevalente della generazione spontanea e ha fornito un forte supporto alla teoria della biogenesi.