Tuttavia, la posizione e i meccanismi specifici della respirazione cellulare variano a seconda della struttura cellulare dell'organismo:
* eucarioti (animali, piante, funghi): La respirazione cellulare si verifica principalmente nei mitocondri , che sono organelli specializzati responsabili della produzione di energia.
* prokaryotes (batteri, archaea): La respirazione cellulare si verifica nel citoplasma e sulla membrana del plasma , poiché mancano i mitocondri.
Pertanto, mentre tutti gli organismi viventi eseguono la respirazione cellulare, il processo e la posizione precisi possono differire in base alla loro organizzazione cellulare.