Ad oggi, gli scienziati stanno studiando sempre più la struttura delle comunità microbiche e la loro composizione associata alle piante, ma pochi lo hanno fatto nel contesto delle malattie vascolari.

Tali studi, anche se, può avere un grande impatto sulla protezione delle colture attraverso lo sviluppo di bioinoculanti e biopesticidi, in particolare per le colture legnose come l'uva, che sono generalmente associati a un uso più pesante di pesticidi chimici.

Ciò è particolarmente vero per un patogeno batterico chiamato Xylella fastidiosa . Quando si moltiplica nei raspi dell'uva e in altre colture legnose, compromette il movimento dell'acqua e dei nutrienti all'interno della pianta. Questo fenomeno, identificato come malattia di Pierce, è una questione ben nota ed economicamente importante nel vino, industrie dell'uva passa e dell'uva da tavola in California.

La malattia di Pierce non ha cura e può uccidere le viti in appena due anni. Trovare un deterrente microbico naturale per X. fastidiosa , l'agente patogeno che causa la malattia di Pierce, può avere un enorme impatto positivo per i viticoltori e sull'ambiente.

Inserisci il dottorando. Elizabeth Deyett, Dott. M. Caroline Roper, Philippe E. Rolshausen, e molti altri ricercatori dell'Università della California-Riverside (UCR). Hanno studiato le comunità microbiche nelle viti e le loro connessioni con la malattia dell'uva di Pierce.

Hanno utilizzato il sequenziamento di nuova generazione e moderni strumenti bioinformatici per caratterizzare i microbiomi batterici e fungini che vivono nelle viti. Hanno analizzato campioni di vite con lievi sintomi della malattia di Pierce, campioni con sintomi gravi, e infine campioni che non mostravano alcun sintomo.

I risultati hanno mostrato che le comunità microbiche all'interno delle viti studiate erano composte principalmente da batteri e funghi, in particolare Proteobacteria e Ascomycota, con Pseudomonodales e Pleosporales, rispettivamente, come i principali ordini batterici e fungini.

I loro dati hanno anche suggerito che il raggruppamento delle comunità batteriche sembrava essere guidato dall'abbondanza del batterio Pseudomonas fluorescens e X. fastidiosa .

"Interessante, abbiamo scoperto che quando il Pseudomonas e Achromobacter specie erano presenti, Xylella fastidiosa era in minore abbondanza, e i sintomi della malattia di Pierce erano meno gravi, " ha detto Rolshausen. "Ciò suggerisce che questi organismi possono contribuire alla salute della vite e avere un potenziale uso come microbi benefici che promuovono la salute delle piante o competono direttamente con l'agente patogeno".

"Questa ricerca è altamente interdisciplinare, che coinvolgono microbiologia, ecologia microbica, patologia vegetale e bioinformatica. E attraverso questa ricerca, stiamo iniziando solo ora a capire quali microbi ci sono, " ha detto Rolshausen. "Questo ispira noi e, si spera, altri a iniziare a comprendere la funzione di questi microbioti residenti".