Virus: I virus sono vettori naturali che possono trasferire il DNA tra diversi organismi. Alcuni virus, come i batteriofagi, possono infettare i batteri e inserire il proprio DNA nel genoma batterico. Altri virus, come i retrovirus, possono inserire il loro DNA nel genoma delle cellule eucariotiche.
Plasmidi: I plasmidi sono piccole molecole circolari di DNA che possono replicarsi indipendentemente dal DNA cromosomico. I plasmidi possono essere progettati per trasportare DNA estraneo e possono essere trasferiti tra batteri attraverso un processo chiamato coniugazione.
Cosmidi: I cosmidi sono grandi plasmidi che possono trasportare frammenti di DNA più grandi rispetto ai plasmidi. I cosmidi possono essere utilizzati per clonare frammenti di DNA fino a 40 kilobasi di dimensione.
Cromosomi artificiali batterici (BAC): I BAC sono molecole di DNA grandi e circolari che possono trasportare frammenti di DNA fino a 300 kilobasi di dimensione. I BAC vengono utilizzati per clonare frammenti di DNA di grandi dimensioni che non possono essere clonati in plasmidi o cosmidi.
Cromosomi artificiali di lievito (YAC): Gli YAC sono grandi molecole di DNA circolari che possono trasportare frammenti di DNA fino a 1 megabase di dimensione. Gli YAC vengono utilizzati per clonare frammenti di DNA molto grandi che non possono essere clonati nei BAC.