1. Basato sulla presenza di flagelli:
* monotrico: Possedere un singolo flagello ad un'estremità.
* Lophotrichous: Avere un gruppo di flagelli ad un'estremità.
* Amphitrichous: Avere un singolo flagellum o ciuffi di flagello ad entrambe le estremità.
* peritrichi: Avere flagelli distribuito sull'intera superficie della cella.
* atrichous: Privo di flagello.
2. Basato sulla disposizione del flagello (per batteri flagellati):
* polare: Flagello situato su uno o entrambi i poli della cellula (monotrichi, lophotrichous, anfitrichous).
* laterale: Flagello situato sui lati della cellula (peritrichi).
Ecco una tabella che riassume le classificazioni:
| Tipo di flagello | Descrizione | Esempio |
| --- | --- | --- |
| Monotrico | Flagellum singolo ad un'estremità | * Vibrio cholerae* |
| Lophotrichous | Cluster di flagella ad un'estremità | * Pseudomonas aeruginosa* |
| Anfitrichous | Flagellum singolo o Tufts ad entrambe le estremità | * Spirillum Volutans* |
| Peritrichi | Flagello distribuito sull'intera superficie | * Escherichia coli* |
| Atrichi | Nessun flagello | * Shigella disenteriae* |
Nota: Questo sistema di classificazione si basa sulla morfologia e sulla disposizione flagellare. Tuttavia, è importante notare che anche altre caratteristiche, come la forma cellulare, la struttura della parete cellulare e le vie metaboliche, sono cruciali per la classificazione batterica.