L'accoppiamento di base tra DNA e RNA segue le seguenti regole:

* adenina (a) in coppie di DNA con uracile (u) in RNA.

* guanina (g) in coppie di DNA con citosina (c) in RNA.

Questo è leggermente diverso dall'accoppiamento del DNA-DNA in cui l'adenina si accoppia con la timina (T). L'RNA usa uracile anziché timina.

Quindi, l'abbinamento di base è:

* a-u

* G-C