Queste sono le categorie più ampie nella classificazione biologica e rappresentano i rami evolutivi più profondi. I tre domini sono:
* Batteri: Prokaryote a celle singole (prive di un nucleo).
* Archaea: I procure a celle singole (prive di un nucleo) che spesso vivono in ambienti estremi.
* Eukarya: Organismi con cellule che hanno un nucleo e altri organelli legati alla membrana. Questo dominio comprende piante, animali, funghi e protisti.
All'interno di ciascun dominio, ci sono ulteriori classificazioni, tra cui regni, phyla, classi, ordini, famiglie, generi e specie.