- Sito di legame del peptide (sito P): Il sito P è responsabile del mantenimento della catena polipeptidica in crescita. Durante la traduzione, la molecola di RNA di trasferimento (tRNA) che trasporta la catena polipeptidica in crescita si lega al sito P.
- Sito amminoacilico (A): Il sito A si trova accanto al sito P ed è dove si lega la molecola di tRNA in arrivo che trasporta un nuovo amminoacido. Le molecole di tRNA si legano prima al sito A dove il loro anticodone corrisponde alla sequenza di tre nucleotidi del codone nell'mRNA.
- Esci dal sito (E): Il sito E è posizionato vicino ai siti A e P e fornisce un punto di uscita per le molecole di tRNA che hanno consegnato il loro amminoacido alla catena polipeptidica in crescita. Dopo che i fattori di rilascio si legano, rilasciando la catena polipeptidica, il tRNA deacilato lascia il sito E.
- Centro peptidil transferasi: Situato vicino ai siti P e A, il centro della peptidil transferasi è responsabile della catalizzazione della formazione di legami peptidici tra l’amminoacido attaccato al tRNA nel sito A e l’amminoacido sul tRNA nel sito P.
Oltre a questi siti di legame del tRNA, la grande subunità ribosomiale contiene siti di legame per vari fattori di traduzione coinvolti nella sintesi proteica, come fattori di allungamento, fattori di rilascio e GTPasi, che svolgono un ruolo cruciale nel facilitare le diverse fasi del processo di traduzione.