Questo lo ha portato a proporre il concetto di alleli , forme alternative di un gene e che ogni singolo eredita due alleli per ciascun tratto, uno di ciascun genitore. Si è anche reso conto che l'allele recessivo è ancora presente nella generazione di F1, anche se non si manifesta. Può riapparire nella generazione di F2 quando due individui F1 vengono attraversati.
Questa scoperta del dominio è stata una svolta cruciale nella comprensione di come i tratti vengono passati dai genitori alla prole e hanno aperto la strada alla genetica moderna.