È stato dimostrato che i coralli coltivati a livelli più elevati di acidità dell'acqua di mare hanno una maggiore metilazione del DNA nei geni legati alla crescita cellulare e allo stress. Credito:© 2018 Eric Tambutté
Un processo che modifica la regolazione dei geni potrebbe aiutare i coralli ad acclimatarsi agli impatti del riscaldamento globale.
Le cellule controllano comunemente l'espressione genica aggiungendo un gruppo metilico a una parte del DNA, modificando il modo in cui vengono lette le informazioni sul DNA senza modificarne il codice genetico. I ricercatori di KAUST volevano indagare se la metilazione del DNA potesse svolgere un ruolo nell'aiutare i coralli ad adattarsi ai cambiamenti climatici.
Posero colonie del corallo cavolfiore liscio, Stylophora pistillata, in acquari marini con acidità variabile per due anni. L'acidificazione degli oceani è una conseguenza del cambiamento climatico e ostacola la capacità dei coralli di produrre lo scheletro di carbonato di calcio di cui hanno bisogno per mantenere le loro strutture. I ricercatori hanno ipotizzato che la metilazione del DNA potrebbe consentire ai coralli di mitigare questi effetti modificando il modo in cui crescono.
Dopo due anni, il team ha sequenziato i genomi dei coralli e determinato i cambiamenti nei modelli di metilazione.
"Abbiamo notato che i coralli cresciuti in condizioni più acide avevano livelli più elevati di metilazione del DNA, " dice il genetista Yi Jin Liew. "I geni con maggiore metilazione erano correlati alla crescita cellulare e alla risposta allo stress, ma non alla calcificazione come inizialmente proposto, " lui dice.
Colonie del corallo cavolfiore liscio, Stylophora pistillata , sono stati posti in acquari marini con diversi livelli di acidità per due anni. Credito:© 2018 Eric Tambutté
In linea con questa constatazione, il team ha scoperto che anche le dimensioni delle cellule e dei polipi nei coralli aumentavano con l'aumento dell'acidità. "I polipi del corallo siedono in piccole cavità chiamate calici in cui possono ritirarsi per proteggersi, " spiega il biologo molecolare Manuel Aranda. I polipi più grandi hanno calici più grandi. "Se il calice è più grande, il corallo ha bisogno di produrre meno scheletro per crescere allo stesso ritmo. Io la chiamo l'ipotesi del formaggio svizzero, ' dove il corallo fa buchi più grandi quindi ha bisogno di fare meno formaggio, che gli consente di crescere alla stessa velocità anche se la produzione scheletrica è compromessa." Questa caratteristica sarebbe vantaggiosa in un ambiente in cui la competizione per lo spazio e la luce è un'importante pressione selettiva.
I risultati indicano che la metilazione del DNA può essere utilizzata come indicatore dello stress dei coralli. Questo meccanismo epigenetico potrebbe anche essere sfruttato per far crescere i coralli in future condizioni oceaniche per prepararli a temperature più elevate prima di posizionarli sulle barriere coralline, dice Aranda. Questo processo è noto come indurimento ambientale.
"Speriamo che il nostro contributo cambierà l'attuale percezione tra i biologi della barriera corallina che l'epigenetica non contribuisca molto alla resilienza dei coralli, "dice Lie.
UN stilofora polipo:il team ha scoperto che le dimensioni delle cellule e dei polipi nei coralli aumentavano con l'aumento dell'acidità. Credito:© 2018 Eric Tambutté
Il team prevede poi di indagare se questi cambiamenti epigenetici possono essere tramandati alle generazioni future. "L'idea è abbastanza rivoluzionaria, "dice Lie.